Nijjar war von den indischen Behörden als Terrorist eingestuft worden, die ihm die Beteiligung an militanten Gruppen und extremistischen Aktivitäten vorwarfen, was er jedoch bestritt. Trudeau hatte Indien aufgefordert, bei der Untersuchung des Mordes zu kooperieren, doch Indien wies die Anschuldigungen als "absurd" und politisch motiviert zurück. Es eskalierte schnell zu einem diplomatischen Streit, als die beiden Länder Spitzendiplomaten auswiesen und Indien alle Visumanträge für Kanadier einstellte.
In der Folge erklärte das indische Außenministerium, dass es von Kanada verlangen werde, die Zahl seines diplomatischen Personals in Indien zu reduzieren. Dies geschah aus Gründen der "Parität", da die Anzahl der kanadischen Diplomaten in Delhi die indischen Diplomaten in Ottawa bei weitem übersteige. Das indische und das kanadische Außenministerium reagierten nicht sofort auf Anfragen nach Kommentaren zu den Berichten, wonach kanadische Diplomaten aufgefordert wurden, das Land zu verlassen.
Trudeau sagte, er habe die Vorwürfe der Ermordung Nijjars erstmals privat beim indischen Premierminister Narendra Modi während des G20-Gipfels der Staats- und Regierungschefs Anfang September in Delhi zur Sprache gebracht, wo sie auch vom US-Präsidenten Joe Biden vorgebracht wurden.
Trudeaus Entscheidung Ende September, mit den Vorwürfen an die Öffentlichkeit zu gehen, hatte Indien verärgert, das im Gegenzug Kanada beschuldigte, ein "sicherer Hafen für Terroristen" zu sein, die an der Separatistenbewegung Khalistani beteiligt sind, die für einen unabhängigen Staat für Sikhs kämpft und in der das Land verboten ist Indien. Die Beweise für Trudeaus Behauptungen müssen noch veröffentlicht werden, offenbar aus Angst, sie könnten die Ermittlungen gefährden. Die US-Regierung hat Indien wiederholt aufgefordert, bei den Ermittlungen mit Kanada zusammenzuarbeiten.
Der indische Außenminister Subrahmanyam Jaishankar beschuldigte Kanada letzte Woche, ein "Klima der Gewalt" gegen indische Diplomaten in Ottawa zuzulassen, und behauptete, dass "unsere Diplomaten bedroht und unsere Konsulate angegriffen wurden". Er bezeichnete die aktuelle diplomatische Situation mit Kanada als "Stillstand".
